他同时还担任海外高层次人才引进计划评审专家、国家“重大新药创制”科技重大专项评审专家、北京市自然科学基金委员会委员、北京市工商业联合会副主席、海淀区政协委员、中关村上市公司协会会长等社会职务。

　　尹卫东是国内最早分离出甲肝病毒者之一，1999年在国内率先研发出甲肝灭活疫苗。2003年，担任国家重大项目“SARS灭活疫苗的研制”课题负责人，在全球率先完成SARS灭活疫苗I期临床试验。2005年担任国家科技攻关项目“人用禽流感疫苗研制”课题负责人，该疫苗于2008年获准生产，使我国人用禽流感疫苗研究与国际同步。2009年在全球率先完成甲型H1N1流感疫苗临床研究，并使我国成为全球最早使用甲流疫苗的国家。2009年12月，尹卫东带领公司的研发团队又率先申报了手足口病疫苗的临床试验申请，目前已完成Ⅲ期临床试验阶，保护效果良好。